La historia principal de Pokémon Conquest consiste en unificar los 17 reinos de Ransei, desde Aurora hasta Dragnor, el reino de Nobunaga. Este es el desarrollo y el orden de las conquistas, según Poképédia y Serebii. El detalle de cada reino está en nuestras páginas de reinos.
1. Aurora y el sur
El héroe acaba de ser proclamado jefe militar de Aurora cuando Koroku y Nagayasu, llegados de Ignis, atacan. Con la ayuda de Oichi, los repele. Oichi explica que todos los reinos se hacen la guerra para cumplir la leyenda. Después hay que conquistar Ignis, el reino de tipo Fuego de Hideyoshi, con sus trampas de llamas y sus aguas termales, y luego Greenleaf (Motonari) y Fontaine (Motochika), cuyo río se cruza accionando dos presas.
2. El centro
Oichi revela que Nobunaga, señor del norte, es la verdadera amenaza. Siguen Violight (Ginchiyo), con sus fosos electrificados y sus interruptores que fulminan a los Pokémon de un color, Chrysalia (Yoshimoto), con trampas ocultas, y Pugilis (Yoshihiro), donde hay que tomar cuatro banderas en un ring del que se puede ser expulsado.
3. Illusio y Terrera
Tras Pugilis aparecen Illusio (Kenshin) y Terrera (Shingen). Illusio ataca primero uno de tus reinos y luego se combate sobre plataformas móviles y agujeros negros. Derrotar a uno de los dos suele bastar para conseguir a ambos: Shingen y Kenshin se unen entonces a tu ejército. Durante la fiesta organizada en su honor, aparece Nobunaga: ahora controla Avia, Cragspur, Yaksha, Viperia, Valora, Nixtorm y Spectra.
4. El norte de Nobunaga
| Reino | Jefe militar | La batalla |
|---|---|---|
| Cragspur | Ujiyasu | Al pie de una montaña, bajo las rocas que hacen rodar los adversarios |
| Viperia | Nene | En un edificio cubierto de veneno y trampillas |
| Yaksha | Kotarō | Un campo cortado por ríos; en cada turno, un Pokémon es arrastrado al azar |
| Avia | Masamune | Plataformas y trampolines, con un puente que se abre al azar |
| Valora | Ieyasu | Rejas que abrir colocando Pokémon sobre engranajes |
| Spectra | Nō | Árboles que talar, estatuas que se mueven y llamas que causan problemas de estado |
| Nixtorm | Mitsuhide | Un lago helado en el que se resbala, con hielo que cede |
5. Dragnor y la Torre Infinita
En Dragnor, Ranmaru, el sirviente de Nobunaga, suplica a Oichi que no se oponga a su hermano mayor. Nobunaga, aliado con Zekrom, desafía a Oichi y al héroe. Tras su derrota aparece la Torre Infinita, y con ella Arceus. El héroe se vincula a Arceus, pero debe enfrentarse una última vez a Nobunaga, ahora asociado a un Rayquaza variocolor, con Mitsuhide, Nō, Ieyasu, Ranmaru y Hideyoshi. Vencido, Nobunaga revela sus verdaderas intenciones: devolver la paz a Ransei gracias al poder de Arceus.
La continuación se juega en los episodios.
