La Zona Flora reúne la Ruta del Molino y el Claro Verde, donde reside Serperior. Cuenta con 43 Pokémon. Aquí tienes cómo hacerse amigo de ellos, según la lista de Poképédia.
| N.º | Pokémon | Cómo hacerse amigo | Lugar |
|---|---|---|---|
| 045 | Karrablast | Hablarle | Ruta del Molino |
| 046 | Cottonee | Ganarle en una carrera | Ruta del Molino |
| 047 | Whimsicott | Ganarle en una carrera | Ruta del Molino |
| 048 | Caterpie | Vencerle en un duelo | Ruta del Molino |
| 049 | Scyther | Vencerle en un duelo — disponible tras hacerte amigo de Mankey | Ruta del Molino |
| 050 | Sudowoodo | Regarlo y luego encontrarlo jugando al escondite | Ruta del Molino |
| 051 | Zorua | Encontrarlo jugando al escondite tras hacerte amigo de Zoroark | Ruta del Molino |
| 052 | Zoroark | Vencerle en un duelo en el Parque de las Ilusiones (historia) | Ruta del Molino |
| 053 | Pawniard | Vencer en combate a Bisharp y a él tras derrotar a Chandelure | Ruta del Molino |
| 054 | Bisharp | Vencer en combate a los Pawniard y a él tras derrotar a Chandelure | Ruta del Molino |
| 055 | Buneary | Encontrarlo jugando al escondite — disponible tras rescatarlo del Parque de las Ilusiones | Ruta del Molino |
| 056 | Leafeon | Superar su circuito — disponible tras rescatarlo del Parque de las Ilusiones | Ruta del Molino |
| 057 | Foongus | Atacarlo y luego ganarle en una carrera | Ruta del Molino |
| 058 | Amoonguss | Vencerle en un duelo — disponible tras hacerte amigo de Foongus | Ruta del Molino |
| 059 | Tympole | Enseñarle una foto de Seismitoad | Ruta del Molino |
| 060 | Seismitoad | Vencerle en un duelo | Claro Verde |
| 061 | Magikarp | Llevarlo hasta el río | Ruta del Molino |
| 062 | Oddish | Regarlo y luego responder correctamente a su cuestionario | Ruta del Molino |
| 063 | Mankey | Vencerle en un duelo | Ruta del Molino |
| 064 | Kakuna | Vencer a los 4 Kakuna a la vez — disponible tras hacerte amigo de Magikarp | Ruta del Molino |
| 065 | Snorlax | Hablarle — disponible tras hacerte amigo de Cottonee | Ruta del Molino |
| 066 | Sewaddle | Ganarle en una carrera — disponible tras hacerte amigo de Oddish | Ruta del Molino |
| 067 | Leavanny | Vencerle en un duelo | Claro Verde |
| 068 | Lilligant | Vencerle en un duelo | Claro Verde |
| 069 | Serperior | Vencerle en un duelo tras completar el juego | Claro Verde |
| 070 | Deerling | Ganarle en una carrera | Claro Verde |
| 071 | Vaporeon | Superar su circuito | Claro Verde |
| 072 | Psyduck | Enseñarle una foto de Emolga — disponible tras rescatarlo del Parque de las Ilusiones | Claro Verde |
| 073 | Shroomish | Responder correctamente a su cuestionario — disponible tras rescatarlo del Parque de las Ilusiones | Claro Verde |
| 074 | Venipede | Vencerle en un duelo | Claro Verde |
| 075 | Whirlipede | Ganarle en una carrera — disponible tras hacerte amigo de Venipede | Claro Verde |
| 076 | Scolipede | Vencerle en un duelo — disponible tras completar el juego | Claro Verde |
| 077 | Skiploom | Darle 3 gotas de rocío | Claro Verde |
| 078 | Surskit | Ganarle en una carrera | Claro Verde |
| 079 | Basculin | Ganarle en una carrera | Los rojos (y uno azul): Claro Verde. Los azules (y uno rojo): Orilla del Lago |
| 080 | Dugtrio | Hablarle | Claro Verde |
| 081 | Ducklett | Ganarle en una carrera tras saltar al agujero de Dugtrio | Claro Verde |
| 082 | Stunfisk | Encontrarlo jugando al escondite — disponible tras hacerte amigo de Ducklett | Claro Verde |
| 083 | Excadrill | Vencerle en un duelo | Claro Verde |
| 084 | Woobat | Ganarle en una carrera — disponible tras abrir la cueva con Tepig | Claro Verde |
| 085 | Ferrothorn | Vencerle en un duelo — disponible tras abrir la cueva con Tepig | Claro Verde |
| 086 | Bronzong | Regarlo — disponible tras abrir la cueva con Tepig | Claro Verde |
| 087 | Burmy | Hablarle — disponible tras completar el juego | Claro Verde |
