Pokémon Puzzle League propose de nombreux modes, du mode Histoire au village Puzzle jusqu’au Laboratoire d’entraînement. Voici chacun, avec les adversaires du mode Histoire selon la difficulté.
Le mode Histoire
Sacha se repose quand le Professeur Chen l’invite à participer au défi du village Puzzle. Il ne peut utiliser que Carapuce, Bulbizarre et Pikachu. Les adversaires dépendent de la difficulté :
| Difficulté | Adversaires |
|---|---|
| Facile | Régis, puis les Champions d’Arène jusqu’à Auguste, avec un Badge à chaque victoire. |
| Normal | Les mêmes, plus Jessie, James et Miaouss, et Giovanni. |
| Difficile | Les mêmes, plus l’Élite Puzzle : Richie, Olga, Aldo et un Régis plus fort. |
| Très difficile | Tous les précédents, puis Mewtwo. En cas de défaite contre Mewtwo, il faut rebattre Régis avant de le réaffronter. |
Le mode Marathon
Jessie, James et Miaouss enlèvent les Pokémon de Sacha, qui part à leur poursuite. Un niveau bonus oppose Butch et Cassidy, et Giovanni attend au bout.
Les autres modes
- Duel, à un ou deux joueurs : tous les personnages sont jouables, sauf Mewtwo.
- Contre la montre : marquer le plus de points dans le temps imparti.
- Laboratoire d’entraînement : Jackie apprend à réaliser des combos.
- Bibliothèque Puzzle : résoudre des énigmes ou en créer, avec Pierre, Olga et Richie.
- Le mode 3D : la pile de blocs forme un cylindre qu’on fait tourner.
Le jeu permet de créer plusieurs profils, pour séparer les records de chaque joueur.
